Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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D13Ertd608eQ3UPR8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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D13Ertd608eQ3UPR8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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D13Ertd608eQ3UPR8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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D13Ertd608eQ3UPR8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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D13Ertd608eQ3UPR8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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D13Ertd608eQ3UPR8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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D13Ertd608eQ3UPR8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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D13Ertd608eQ3UPR8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms