Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms