Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms