Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cobll1Q3UMF0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms