Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Garem1Q3UFT3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Garem1Q3UFT3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Garem1Q3UFT3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Garem1Q3UFT3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Garem1Q3UFT3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Garem1Q3UFT3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms