Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Puf60Q3UEB3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms