Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms