Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp8Q3UD82 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp8Q3UD82 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp8Q3UD82 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp8Q3UD82 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp8Q3UD82 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp8Q3UD82 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp8Q3UD82 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp8Q3UD82 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp8Q3UD82 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp8Q3UD82 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp8Q3UD82 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp8Q3UD82 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp8Q3UD82 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp8Q3UD82 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp8Q3UD82 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp8Q3UD82 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp8Q3UD82 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp8Q3UD82 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp8Q3UD82 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp8Q3UD82 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp8Q3UD82 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms