Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem109Q3UBX0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem109Q3UBX0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem109Q3UBX0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem109Q3UBX0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem109Q3UBX0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem109Q3UBX0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem109Q3UBX0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem109Q3UBX0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem109Q3UBX0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem109Q3UBX0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem109Q3UBX0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem109Q3UBX0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem109Q3UBX0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem109Q3UBX0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem109Q3UBX0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem109Q3UBX0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem109Q3UBX0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem109Q3UBX0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem109Q3UBX0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem109Q3UBX0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem109Q3UBX0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem109Q3UBX0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms