Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Rnf180Q3U827 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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