Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms