Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms