Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Palb2Q3U0P1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms