Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc102aQ3TMW1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms