Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms