Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmem248Q3TBN1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem248Q3TBN1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms