Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbtb38Q3LR78 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbtb38Q3LR78 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms