Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpm1Q2TV84 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpm1Q2TV84 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpm1Q2TV84 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpm1Q2TV84 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpm1Q2TV84 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpm1Q2TV84 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpm1Q2TV84 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpm1Q2TV84 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpm1Q2TV84 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpm1Q2TV84 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpm1Q2TV84 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpm1Q2TV84 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpm1Q2TV84 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpm1Q2TV84 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpm1Q2TV84 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpm1Q2TV84 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpm1Q2TV84 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpm1Q2TV84 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpm1Q2TV84 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpm1Q2TV84 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpm1Q2TV84 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpm1Q2TV84 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpm1Q2TV84 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.8
Trpm1Q2TV84 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trpm1Q2TV84 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trpm1Q2TV84 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trpm1Q2TV84 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Trpm1Q2TV84 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trpm1Q2TV84 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trpm1Q2TV84 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trpm1Q2TV84 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trpm1Q2TV84 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpm1Q2TV84 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpm1Q2TV84 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpm1Q2TV84 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpm1Q2TV84 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpm1Q2TV84 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpm1Q2TV84 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpm1Q2TV84 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms