Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd11Q1RNF8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms