Protein–RNA interactions for Protein: Q14B01

Rnf113a2, Ring finger protein 113A2, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf113a2Q14B01 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf113a2Q14B01 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf113a2Q14B01 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf113a2Q14B01 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf113a2Q14B01 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf113a2Q14B01 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf113a2Q14B01 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf113a2Q14B01 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf113a2Q14B01 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf113a2Q14B01 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf113a2Q14B01 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf113a2Q14B01 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf113a2Q14B01 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf113a2Q14B01 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf113a2Q14B01 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf113a2Q14B01 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf113a2Q14B01 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf113a2Q14B01 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnf113a2Q14B01 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnf113a2Q14B01 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnf113a2Q14B01 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnf113a2Q14B01 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnf113a2Q14B01 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnf113a2Q14B01 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnf113a2Q14B01 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf113a2Q14B01 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms