Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms