Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rundc1Q0VDN7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms