Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms