Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Spata18Q0P557 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms