Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms