Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnma1Q08460 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms