Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms