Protein–RNA interactions for Protein: Q08297

Rad51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51Q08297 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad51Q08297 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad51Q08297 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad51Q08297 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad51Q08297 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad51Q08297 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad51Q08297 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad51Q08297 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad51Q08297 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad51Q08297 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad51Q08297 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad51Q08297 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad51Q08297 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad51Q08297 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad51Q08297 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad51Q08297 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms