Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tgm3Q08189 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms