Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms