Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13bQ07968 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13bQ07968 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13bQ07968 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13bQ07968 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13bQ07968 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13bQ07968 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F13bQ07968 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F13bQ07968 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
F13bQ07968 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
F13bQ07968 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F13bQ07968 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms