Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms