Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms