Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnal1Q05A62 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnal1Q05A62 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnal1Q05A62 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnal1Q05A62 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnal1Q05A62 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnal1Q05A62 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnal1Q05A62 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnal1Q05A62 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnal1Q05A62 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnal1Q05A62 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnal1Q05A62 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnal1Q05A62 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnal1Q05A62 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnal1Q05A62 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnal1Q05A62 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnal1Q05A62 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnal1Q05A62 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnal1Q05A62 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnal1Q05A62 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnal1Q05A62 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnal1Q05A62 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnal1Q05A62 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnal1Q05A62 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnal1Q05A62 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnal1Q05A62 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnal1Q05A62 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnal1Q05A62 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnal1Q05A62 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms