Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms