Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms