Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk18Q04899 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk18Q04899 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk18Q04899 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk18Q04899 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk18Q04899 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk18Q04899 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk18Q04899 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk18Q04899 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk18Q04899 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk18Q04899 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk18Q04899 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk18Q04899 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk18Q04899 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk18Q04899 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk18Q04899 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk18Q04899 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk18Q04899 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk18Q04899 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk18Q04899 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk18Q04899 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk18Q04899 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk18Q04899 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdk18Q04899 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdk18Q04899 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdk18Q04899 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms