Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sox9Q04887 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox9Q04887 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox9Q04887 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox9Q04887 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox9Q04887 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox9Q04887 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox9Q04887 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox9Q04887 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox9Q04887 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox9Q04887 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox9Q04887 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox9Q04887 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox9Q04887 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox9Q04887 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox9Q04887 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox9Q04887 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox9Q04887 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox9Q04887 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox9Q04887 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox9Q04887 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox9Q04887 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox9Q04887 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox9Q04887 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox9Q04887 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox9Q04887 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms