Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms