Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RelaQ04207 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RelaQ04207 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RelaQ04207 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms