Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tff2Q03404 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms