Protein–RNA interactions for Protein: Q03172

Hivep1, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 2,688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep1Q03172 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hivep1Q03172 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms