Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ddr1Q03146 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms