Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna1sQ02789 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms