Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms