Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms