Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zfp39Q02525 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp39Q02525 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms