Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Muc1Q02496 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Muc1Q02496 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Muc1Q02496 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Muc1Q02496 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Muc1Q02496 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Muc1Q02496 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Muc1Q02496 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Muc1Q02496 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms