Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms