Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RykQ01887 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RykQ01887 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RykQ01887 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RykQ01887 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RykQ01887 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RykQ01887 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RykQ01887 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RykQ01887 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RykQ01887 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RykQ01887 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RykQ01887 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RykQ01887 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RykQ01887 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RykQ01887 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RykQ01887 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RykQ01887 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RykQ01887 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RykQ01887 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RykQ01887 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RykQ01887 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RykQ01887 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RykQ01887 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RykQ01887 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RykQ01887 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RykQ01887 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RykQ01887 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RykQ01887 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RykQ01887 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RykQ01887 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RykQ01887 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RykQ01887 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RykQ01887 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RykQ01887 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RykQ01887 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RykQ01887 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RykQ01887 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RykQ01887 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RykQ01887 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RykQ01887 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RykQ01887 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RykQ01887 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RykQ01887 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RykQ01887 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RykQ01887 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RykQ01887 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RykQ01887 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RykQ01887 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RykQ01887 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RykQ01887 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RykQ01887 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RykQ01887 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RykQ01887 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RykQ01887 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RykQ01887 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RykQ01887 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RykQ01887 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RykQ01887 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RykQ01887 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RykQ01887 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RykQ01887 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RykQ01887 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RykQ01887 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RykQ01887 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RykQ01887 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RykQ01887 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RykQ01887 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RykQ01887 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RykQ01887 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RykQ01887 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RykQ01887 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RykQ01887 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RykQ01887 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RykQ01887 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RykQ01887 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RykQ01887 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RykQ01887 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RykQ01887 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RykQ01887 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RykQ01887 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RykQ01887 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RykQ01887 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RykQ01887 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RykQ01887 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RykQ01887 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RykQ01887 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RykQ01887 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RykQ01887 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RykQ01887 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RykQ01887 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RykQ01887 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RykQ01887 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RykQ01887 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RykQ01887 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RykQ01887 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RykQ01887 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RykQ01887 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RykQ01887 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RykQ01887 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RykQ01887 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms